Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms