Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms