Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms