Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XPCQ01831 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XPCQ01831 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms