Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms