Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms