Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms