Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms