Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX1P78414 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRX1P78414 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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