Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms