Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTBP2P56545 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms