Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLE2P56282 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLE2P56282 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLE2P56282 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms