Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms