Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TAF6P49848 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms