Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRPC1P48995 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms