Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NESP48681 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NESP48681 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NESP48681 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NESP48681 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NESP48681 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NESP48681 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NESP48681 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NESP48681 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NESP48681 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NESP48681 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms