Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCLMP48507 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCLMP48507 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCLMP48507 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCLMP48507 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms