Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV4P43268 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV4P43268 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms