Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms