Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJC1P36383 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms