Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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