Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR1EP28566 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms