Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms