Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms