Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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