Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LMNB1P20700 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms