Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CREB1P16220 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms