Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRG2P13727 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRG2P13727 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PRG2P13727 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PRG2P13727 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRG2P13727 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRG2P13727 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRG2P13727 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRG2P13727 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRG2P13727 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRG2P13727 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRG2P13727 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRG2P13727 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PRG2P13727 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRG2P13727 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRG2P13727 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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