Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms