Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TMEM225BP0DP42 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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