Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms