Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC166P0CW27 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms