Protein–RNA interactions for Protein: P0C870

JMJD7, JmjC domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD7P0C870 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JMJD7P0C870 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms