Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms