Protein–RNA interactions for Protein: P01127

PDGFB, Platelet-derived growth factor subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFBP01127 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDGFBP01127 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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