Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms