Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKNO60260 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKNO60260 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKNO60260 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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