Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms