Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLGNO14967 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLGNO14967 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms