Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBFD1O14562 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBFD1O14562 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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