Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E9PBE3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E9PBE3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E9PBE3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E9PBE3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms