Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms