Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms