Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms