Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD54L2Q9Y4B4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD54L2Q9Y4B4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms