Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP3Q9Y3E7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHMP3Q9Y3E7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms