Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1BQ9UPS6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms