Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH3Q9UHC1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms