Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM8A1Q9UBU6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms