Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms